Screening Genetico Preconcezionale della Coppia

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Presso il nostro Poliambulatorio è possibile effettuare lo Screening Genetico Preconcezionale della Coppia attraverso l’analisi dei Pannelli Genetici, la quale viene effettuata mediante tecnica NGS (Next Generation Sequencing) di Grado Clinico, una nuova analisi genetica a fini diagnostici basata sul sequenziamento (cioè la “lettura”) dell’intero esoma.

L’esoma rappresenta l’insieme delle porzioni del nostro genoma (l’intero corredo genetico ereditato dai genitori) che fornisce “istruzioni” per fabbricare le proteine dell’organismo. Sebbene corrisponda ad appena l’1-2% del genoma, è nell’esoma che avviene la quasi totalità delle mutazioni (oltre l’85%) associate a malattie genetiche.

Il test è in grado di valutare, simultaneamente e integralmente, oltre 20,000 geni nello stesso individuo. Pertanto, differisce dalle analisi genetiche “tradizionali” che analizzano numeri ristretti di mutazioni o geni, e i cui risultati spesso risultano inconcludenti a fini diagnostici a causa della complessità genetica delle patologie in oggetto.

Lo screening genetico preconcezionale della coppia si distingue anche da altri servizi basati su analoghe tecnologie di sequenziamento del DNA di nuova generazione, sia per l’accuratezza analitica (ogni posizione sul DNA viene valutata in media circa 90 volte), sia per l’approccio interpretativo, che si basa sulla valutazione di una serie di banche dati e sull’impiego di criteri analitici alternativi (Phenotype-driven analysis).

Come viene svolto lo screening genetico preconcezionale della coppia?

L’analisi richiede un prelievo di una piccola quantità di sangue periferico o saliva del paziente (per le quantità necessarie, seguire le istruzioni del laboratorio) e, talvolta, anche dei genitori o familiari stretti.

Da questo campione viene estratto il DNA necessario per il sequenziamento tramite la tecnica del “Next Generation Sequencing”. Una volta ottenute le sequenze, queste vengono analizzate e interpretate in funzione dei più recenti dati genetici presenti nella letteratura medico-scientifica internazionale, riguardo alle patologie o alla sintomatologia in questione.

Le eventuali varianti patologiche identificate vengono confermate nel campione di origine impiegando tecnologie alternative, come il sequenziamento Sanger. Data la complessità dei dati, la loro interpretazione avviene in due fasi:

Fase 1: Ricerca di mutazioni in geni riconosciuti avere rilevanza clinica nelle patologie in questione (ricerca focalizzata su pannelli “geni-malattia”).
Fase 2: Ricerca di mutazioni in geni con sospetta rilevanza clinica nelle patologie o sintomatologie in questione, sulla base delle attuali conoscenze scientifiche.

Quali sono i possibili risultati dell’analisi? In che tempi?

I possibili risultati di un’analisi genetica basata sul sequenziamento con la metodologia NGS sono:

Risultato Positivo: Identificazione di una o più alterazioni genetiche (mutazioni) note essere responsabili della condizione patologica in questione.
Risultato Incerto: Identificazione di una o più alterazioni genetiche che, sulla base delle attuali conoscenze scientifiche, hanno significato clinico incerto o non chiaro in relazione alla condizione patologica in questione.
Risultato Negativo: Nessuna alterazione genetica identificata che, sulla base delle attuali conoscenze scientifiche, possa spiegare la condizione patologica in questione.

L’emissione del referto da parte del Laboratorio può avvenire tra i 60 e i 120 giorni dall’arrivo del campione, a seconda del pannello genetico richiesto e/o dell’eventuale urgenza.

Il referto verrà inviato, in duplice copia, esclusivamente al Medico che ha richiesto l’analisi o alla Struttura sanitaria alla quale appartiene. Esso conterrà, oltre al risultato, anche la lista dei geni presi in considerazione ed i relativi dettagli informativi.

Qual è l’impatto delle conoscenze scientifiche?

L’interpretazione delle varianti genetiche, e quindi il risultato dello screening genetico preconcezionale della coppia, si basa sulle conoscenze scientifiche disponibili al momento dell’analisi.

Tuttavia, le conoscenze sulla funzione dei geni e delle loro varianti nelle malattie stanno aumentando rapidamente. È possibile che, al momento dell’analisi, la causa genetica alla base della condizione patologica in questione non sia ancora stata individuata, ma che possa essere identificata con il progredire delle conoscenze.

Analogamente, a una variante genetica definita oggi “di significato sconosciuto o incerto” potrebbe, nell’immediato futuro, essere attribuita rilevanza clinica.

Quali sono i limiti dell’analisi?

Pur assicurando il rilevamento di oltre l’85% di tutte le variazioni di rilevanza clinica sull’intero corredo genetico di un individuo, come tutte le tecniche analitiche, lo screening genetico preconcezionale della coppia presenta dei limiti di tipo tecnico:

rileva solo le varianti presenti nella regione codificante dei geni e che compromettono la funzione proteica;
rileva unicamente mutazioni di tipo puntiforme, insieme a piccole inserzioni o delezioni nel DNA.

Altri tipi di alterazioni del DNA non vengono rilevate piccole porzioni dell’esoma (di solito, globalmente inferiori al 10%) possono presentare caratteristiche che ne rendono problematica l’analisi. Tali porzioni potrebbero rimanere in parte escluse dai risultati, in quanto intrinsecamente difficili da valutare con qualunque tecnica di sequenziamento.

Possibili problematiche legate alla gestione dei risultati?

Trattandosi di dati genetici, è verosimile che questi abbiano delle implicazioni, oltre che per il soggetto che si sottopone all’analisi, anche per uno o più dei suoi familiari.

Ad esempio, nel caso in cui venga riscontrata una mutazione che aumenta il rischio di sviluppare una determinata malattia, altri membri della famiglia potrebbero essere portatori della stessa mutazione. Questo tipo di informazione potrebbe quindi generare allarme anche in persone che non hanno richiesto di sottoporsi all’indagine.

D’altro canto, questo aspetto può essere considerato anche in chiave positiva, in quanto l’informazione sarà potenzialmente utilizzabile a fini preventivi in relazione ad altri componenti della famiglia.

Ancora a livello familiare, in alcuni casi, quando le/a mutazioni/e riscontrate/a sono presenti in eterozigosi o nel caso di mutazioni de-novo, è fondamentale analizzare anche il DNA dei genitori/parenti stretti.

Talvolta, potrebbe verificarsi la necessità di confermare la relazione di parentela con il probando. Va qui considerato che nel caso sia necessaria l’analisi di segregazione famigliare, il risultato è strettamente legato alla corretta indicazione dei legami di parentela dei soggetti analizzati.

Un altro aspetto da considerare è la possibilità di risultati “accidentali” di potenziale rilevanza clinica. Ciò avviene, per esempio, nel caso in cui l’analisi riveli la presenza di una o più varianti genetiche che hanno rilevanza per patologie distinte da quelle per le quale si è richiesto l’esame. Vale, per questa situazione, quanto detto per il caso precedente, con la differenza che qui anche il paziente che si sottopone all’esame si troverà ad affrontare informazioni inattese.

Questa possibilità viene segnalata anche nel modulo di consenso informato, che richiede esplicitamente al paziente di scegliere se acconsentire o meno a essere messo a conoscenza di eventuali risultati “accidentali”. Se il paziente sceglie di non acconsentire, i risultati che esulano dallo stretto ambito della richiesta non verranno trasmessi al paziente. Va infine ricordato che il paziente ha l’accesso ai soli dati genetici emergenti dall’analisi, e dai processi analitici a essa correlati, dei geni rientranti nella richiesta del Medico Specialista.

Per qualsiasi altra domanda di dati, questa deve avvenire su specifica richiesta del medico specialista. Il referto finale viene inviato in duplice copia al medico specialista richiedente.